碳金融交易面临较高的信用风险。2009年，欧盟排放交易体系曝出“旋木欺诈”，进口单位通过将进口碳信用转手出售给境内企业，从中骗取增值税。“旋木欺诈”对本国的碳金融交易及税收系统造成较大的负面影响。基于项目的交易，由于信息不对称，参与主体从自身利益着眼的个体经济容易导致行为选择结果的集体不经济。与一般信用风险相比，碳金融交易的信用风险具有双重不对称的特征：

(1)在碳金融交易中，收益和风险分布的不对称性特征更加突出。一般来讲，信用风险的概率分布非正态，具有非对称性。对碳金融信用风险来讲，收益与风险的不对称性更加突出。例如，对于CDM项目来讲，受到政策因素、审批结果不确定以及CERs价格变动等因素的影响，其概率分布呈现左倾趋势，即收益相对固定，但风险损失上限难以确定。

(2)碳金融交易信息不对称的现象更加显著。碳金融交易是金融市场的新生事物，交易双方很难获取政策规定、操作流程、交易对手的完美信息，容易滋生“逆向选择”与“道德风险”。