国家政策的制定和落实对于环保产业有着至关重要的影响。目前国家对于环保产业的发展和公共基础设施的建设十分重视，也推出了诸多政策推动产业发展，但是同时也坦言，不同政府部门之间的政策还需进一步统一和明确，同时完善补贴机制，推动产业更加高效发展。

中投顾问在《2016-2020年中国大气污染防治产业投资分析及前景预测报告》中提出，环保产业很多都是直接向政府和国有企业提供服务的产业，它的所有风险和交易结构都取决于甲方，取决于甲方的信誉、成熟度、付费意愿、资金充裕程度以及对这个产业的理解，甲方有没有足够的资金来采购，是否愿意来采购，提供什么样的标准，这是环保行业面临的一大挑战。

与此同时，国内污染治理市场次第打开，各个细分行业、新兴领域加速成型发展。在这一过程中，产业对技术、对管理水平提出更高要求，环保企业的专业竞争力和综合实力将面临考验。

环保细分领域众多，门槛高低不一，那些确立平台型发展战略的环保企业，未来可望获得更大发展空间，资产并购或成为这些企业拓展新领域的重要手段。

环保产业发展面临另外一个重要挑战还来自于公众的非理性情绪。公众和社会对水价、水质、水污染、选址、垃圾焚烧、地沟油的关注和质疑，正在快速抬高环境服务的标准，而服务价格跟不上服务标准提高的步伐，也是当前环保产业需要解决的重要问题。