六月全国大部分试点进入履约期，北京、上海、广东、深圳和天津相继完成履约任务，湖北和重庆尚未公布履约截止期限。受履约期影响，全国现货市场成交量与成交额大幅上扬，共成交配额1838万吨，交易额34161万元，分别比五月上升了117%和162%。六月，深圳成交452万吨，与五月相比上升1763%；上海成交448万吨，与五月相比上升87%；北京成交381万吨，与五月相比上升135%；广东成交462万吨，与五月相比上升57%；天津成交36万吨，与五月相比上升50374%；湖北成交58万吨，与五月相比下降54%，五月湖北远期成交9487万吨；重庆无成交。

在二级市场价格方面，北京试点配额价格最高，波动范围在39-55元/吨；深圳次之，价格在28-55元/吨；天津价格平稳，在14-23元/吨浮动；受远期产品市场挤压，湖北现货市场波动范围在在15-16元/吨；广东价格在8-15元/吨；上海价格最低，波动范围在5-9元/吨。

截至2016年6月30日，现货及远期市场累计成交35417万吨，成交额89.8亿元。