欧盟ETS初始配额分配的经验和教训对我国排污权交易机制的建立有很好的借鉴作用。他们的实践证明无偿分配配额方式虽然便于企业接受，但欠公平，因为垄断企业通过免费的配额可以获得“额外利润”，竞争企业却要承受更多的经济负效应。不过，并非ETS机制本身偏向某类企业，而是企业的市场地位导致了这样的结果。拍卖方式虽从表面上增加了企业的成本，影响了企业的竞争力，但通过分析和比较，不难发现拍卖和无偿分配对企业竞争力的影响程度并没有实质性的差别。而拍卖更能维持ETS的公平性并能起到稳定市场价格的积极作用，更为重要的是拍卖方式能有效抑制政府部门的“寻租”行为。我国排污权交易机制尚处于开始阶段，在保证新制度顺利实施的同时，还要考虑其可持续性，排污权初始配额的拍卖方式在诸多方面都优于无偿分配方式。选择拍卖方式，对我国ETS的建立，尤其是对嘉兴这样已经成功度过启动阶段的区域性ETS的发展和壮大，都有重大的积极意义。