一般而言，从效率角度出发，碳交易体系更适合于大的排放主体，而小的排放主体更适合采取碳税的方式进行规制。因此针对不同行业、不同排放源、不同规模的主体适用不同的政策，可以确保碳定价机制覆盖到所有的排放主体，同时又避免造成同一主体的负担过重。

在欧洲，欧盟排放交易体系（EU ETS）覆盖了电力部门和大工业部门，而碳税则覆盖了来自汽车燃料、居民部门和小工业部门等非ETS排放部门——这些部门贡献了欧洲55%的二氧化碳排放量。所以，新开征碳税的欧盟国家，一般将受EUETS规制的主体排除在碳税的范围之外。如法国2014年开征的碳税主要针对天然气、石油和煤炭等化石燃料征收，它与EU ETS并行存在，没有交叉；葡萄牙2015年开征的碳税同样仅适用于非EU ETS部门使用的能源产品。那些在EU ETS实施之前已经征收碳税的国家，一般也在EU ETS实施后修改税法，免除EUETS覆盖主体的碳税义务，如冰岛、瑞典、丹麦等国。

当然，碳税和碳交易并非不可同时覆盖同一部门，为了更好实现减排目标，对一些高排放部门，一些国家在将其覆盖进碳交易体系的同时也对其保持征收碳税，其中较为典型的国家是挪威。

在挪威，当EU ETS 开始运行时，由于其众多经济部门已经纳入了碳税的征税范围，因此一些部门（主要是油气部门）并没有与其他欧盟国家一样纳入ETS第一阶段的覆盖范围。在这一阶段，挪威只有10%的二氧化碳排放量（主要来自加工工业）纳入了ETS。从2008年第二阶段开始，挪威不再允许其需要缴纳碳税的油气、造纸等部门免于进入EUETS。也就是说，从2008年开始，挪威的油气等部门既需要缴纳碳税，同时又受EU ETS规制。接着，挪威国内的航空业在2012年也开始同时受两个政策的规制。最新数据显示，挪威油气部门和国内航空部门占全国二氧化碳碳排放量的26%；只受ETS规制的制造业部门，占挪威二氧化碳排放量的22%，而只需缴纳碳税的热电、道路交通、渔业等部门，占挪威二氧化碳排放量的36%。