碳市场的整体运转需要有相应配套的支撑工具才能顺利运转，最主要的支撑工具为碳配额注册登记系统、碳排放数据报送系统以及碳交易系统。碳配额登记注册系统是用于记录排放权的创建、归属、转移及注销等状态及过程的工具，是配额及减排信用赖以存在的物理基础。

从本质上来说注册登记系统就是一本账簿，记录了配额（或减排信用）从产生到更换所有者到最后注销的全过程。碳排放数据报送系统是用于排放单位向主管部门报告有关碳排放数据信息的系统，是政府进行碳市场数据管理的数据基础。报送系统既可以是原始的纸笔记录，也可以是电子文档记录，但由于填报信息的复杂性，使用电子化系统能够确保信息的准确性以及管理上的灵活性。碳交易系统是交易所用于撮合市场交易的系统，主要用于碳排放权交易。目前已经确定注册登记系统由湖北省承建，交易系统由上海市承办，两个系统正在紧张建设中。