碳排放配额分配是
碳交易制度设计中与企业关系最密切的环节。碳交易体系建立以后，由于配额的稀缺性将形成
市场价格，因此配额分配实质上是财产权利的分配，配额分配方式决定了企业参与碳交易体系的成本，并直接影响到企业的
减排效果。配额分配的类型可以分为免费分配和有偿分配两类。
免费分配即配额以无偿的方式分给企业，常用的免费分配的方法包括祖父法（grandfathering）和基准分配法（benchmarking），前者根据历史排放发放配额（因此也被称为“历史法”），历史法经常会出现的
问题是“鼓励落后”，即过去在“减排控排”方面做得并不好的企业，由于其历史排放高而得到了更多的配额；
后者根据一定的基准发放配额，这种分配方式可以做到“鼓励先进”，但对于基准的设计和数据基础的科学性和准确性要求很高。配额的有偿分配分为拍卖和固定价格出售两种，前者由购买者竞标决定配额价格，后者由出售者决定配额价格。目前中国碳
排放权交易市场中前期配额分配主要以免费分配为主，具体采用基准值法和历史法进行分配。
2017年5月，国家发改委公布了
电力、
水泥和电解铝行业的配额分配方案的讨论稿，基本工作思路为“基准线法+预分配”。下阶段生态环境部会根据试算结果，继续完善相关行业配额分配工作方案，制定更加完善、科学、合理的配额分配方法。
