碳汇交易是将能够产生碳汇的生态产品通过碳信用转换成温室气体排放权，以获得生态补偿的市场化手段。通过碳汇交易能够实现生态保护行为的货币化激励，并保障减排行为能够始终发生在边际效益最大的区域。相比于海洋碳汇，由于计量与评估较为简便，森林碳汇已成为《京都议定书》中代替二氧化碳减排的主要方式。根据《京都议定书》，发达国家可以通过技术援助、资金支持的形式在发展中国家建设森林碳汇项目。

目前，中国已获得联合国清洁发展机制执行理事会签发的清洁发展技术计划（CDM 计划）项目共计 1 557 项，在全球总的 CDM 计划项目签发量中占比最大。由于我国还是发展中国家还无须承担强制碳汇帮扶任务，我国的减排交易实践主要以基于碳配合的交易为主。

海洋碳汇的作用已经在海洋微生物沉降、滨海湿地等多个方面形成国际共识。海洋碳汇与森林碳汇的交易是碳配额交易的一个重要补充。通过将海洋碳汇交易纳入碳排放交易体系，可完善国内碳排放交易市场，推动国内海洋碳汇能力建设，使我国碳实力得到进一步提高；进而，随着国际碳排放谈判格局的变化，将海洋碳汇交易推向国际范围。

与碳配额交易的方式不同，海洋碳汇交易的基础需要建立在由国家推出的统一基金的基础上。在配额交易中，交易主体为产生碳排放的生产企业。通过事先确定配额，企业基于各自生产中的排放情况，选择进行交易的价格与交易对象，而海洋碳汇的交易需要对相应项目实际产生效果进行较长时间的追踪并进行估计。