为对碳市场进行风险管理，大部分碳市场都设有市场稳定机制，一般通过控制配额的市场流通量和配额的市场价格两种方式进行。欧盟碳市场在2019年建立了市场稳定储备（Market Stability Reserve, MSR），以解决配额市场上可能出现的供需不平衡问题。当市场流通配额数量高于或低于特定限值时，一定数量的配额将被回收至MSR或反向发放至市场。

美国的碳市场也设有类似的配额储备机制，同时还使用价格区间来缩小碳价波动的空间。美国加利福尼亚州的碳市场设定了碳价的上限和下限，以避免碳价过低导致的市场低迷，或者碳价过高对生产活动造成过高的成本。

根据生态环境部印发的《碳排放权交易管理规则（试行）》，生态环境部可以根据维护全国碳排放权交易市场健康发展的需要，建立市场调节保护机制。

当交易价格出现异常波动触发调节保护机制时，生态环境部可以采取公开市场操作、调节国家核证自愿减排量使用方式等措施，进行必要的市场调节。目前，具体的风险管理触发条件和市场稳定手段还尚未明确。