一旦完成核查与核证程序，项目参与方就可以开始推动CERs的签发。首先，DOE应使用『递交检查与核证报告及提请签发的CDM表格（CDM Form to Submit Verification and Certification Reports and to Request Issuance F-CDM-RFQCERS）』,连同完成的核查、核证报告，通过UNFCCC的CDM网站上的特定电子提交工具，发送给执行理事会秘书处。

　　秘书处正式受理后15天内，除非项目活动涉及方或至少3个执行理事会委员提出审查（一般限于有无欺诈、DOE的渎职或能力欠缺等审查），执行理事会将指示CDM注册官签发特定时段具体数量的CERs，同时会告知项目参与方，并对外公布于UNFCCC的CDM网站上。

　　如果执行理事会拒绝签发CERs的理由可通过修改核查核证报告等手段来解决，那么DOE还可以修改监测报告，并提请对同一时间内的CERs作第二次签发，执行理事会则会在下次会议中个案决定。如再次被拒，则没有可能第三次提请签发CERs.

　　按照CDM项目模式和程序的规定，每次签发CERs时作为CDM管理费用的『收益分配』（SOP-Admin）应当完成，CERs的签发才算生效。当然，项目注册时已经缴纳的『预付』注册费应当从中扣除。另外，所有CERs的2%部分将自动扣除划拨到一个特殊账户，即所谓的『适应收益分配（SOP-Adaptation）』账户，为支持那些特别容易受到气候变化危害的发展中国家提供资金。在最不发达国家境内开发和执行的CDM项目活动，可以免除缴纳此项费用。