欧盟ETS是一款以环保为最终目的的机制，而经济发展与环境保护历来都是一对矛盾。不少企业把环境保护看着是戴在自己头上的紧箍咒，然而如果没有这道紧箍咒,逐利的企业完全可能把高速的发展建立在破坏环境的基础上。在此背景下，的配额初始分配方式对企业竞争力的影响就是不可忽略的。

       无偿分配的方式看似更有利于企业，因为免费的配额让企业不用担心成本的增加而降低竞争力。但是通常被忽略的一个问题是相当多的ETS企业对内处于垄断地位，对外也未必会直接面临来自国外的竞争。比如能源企业，它们在国内仅有几个竞争对手，若因扫澈问题而导致成本上升，大家也都会面临同样的压力，而来自国外的竞争则几乎没有。对这类垄断寡头，无偿分配配额犹如它们的免费午餐，而配额拍卖方式却并不会削弱其竞争力。

        竞争力会受到影响的企业,主要是水泥、钢铁、有色金属以及一些化工企业,因为他们要面临来自欧盟ETS以外的国际竞争者。对它们来说,免费的配额只能算做一次性的补助,不能改善边际成本。而从长期来看,企业因受到ETS的激励,加大环保技术研发力度,从而增强自身的“绿色竞争力”,这种效果未必会输于用无偿分配的方式来帮助维持眼前的市场规模和地位。