免费发放是管理当局将核算好的排放权无偿发给企业；拍卖则是按照一定规则，企业通过竞拍获得碳排放权。政府可将拍卖所得用于补贴企业由于承担减排任务而出现的损失，鼓励清洁能源发展和减排技术的研发等。

　　各国在减排初期，为减少企业的成本压力，通常都免费发放大部分排放权，试行拍卖小部分，再逐步增加排放权拍卖比例。在ETS的第一阶段，欧盟规定通过拍卖发放的排放权不超过总量的5%，其他均实行免费发放。实际上只有丹麦、匈牙利、立陶宛和爱尔兰采用拍卖，排放权拍卖量分别只占其总量的5%、2.5%、1.5%、0.75%。初期由于电力部门的自然垄断特性，较容易转嫁成本，因而排放权拍卖只相对电力企业。如果市场价格公开透明，拍卖成交价往往与市场价趋同。例如，2006年2月17日，爱尔兰的拍卖价格为一单位排放权26.3欧元，同日碳排放交易市场价格为26.85欧元（Convery, Redmond 2006）。

　　ETS第一阶段的经验表明，免费发放存在一定问题（Aluman， Burtraw, Kruger,& Zetterberg, 2007）。企业在申报碳排放量时往往有所夸大，各国政府为保护本国企业也倾向于为企业提供更宽松的环境，过量发放排放权，导致碳交易量下降、价格过低，降低企业减排动力。同时，从ETS和美国SO2排放权交易情况看，尽管排放权免费分配，但企业在减排过程中仍会出现成本上升、将成本转嫁消费者的现象，使消费者受到损失。而通过拍卖来发放排放权，企业获得排放权的成本提高，减排面临更大压力和动力，有助于更好地实现减排目标（World Bank， 2009）。政府可将拍卖收入用于补贴消费者，或给企业或消费者减税，提高生产和消费的积极性，促进经济增长。

　　总之，随着碳排放权交易市场各项制度的逐步完善和市场的平稳运行，各国增加排放权拍卖是大势所趋。欧盟规定2013年拍卖约50%的排放权，其中电力行业全部排放权都通过拍卖发放。2013-2020年，每年拍卖的EUA将达13亿个，价值250-400亿美元。到2020年，各行业碳排放权拍卖比重将增至70-80% (Ellerman,Buchner,2007)。在美国，已经众议院通过的《清洁能源与安全法案》（还有待参议院通过和总统签署才能成为法律）规定，在法律实施的最初几年，将免费发放80%排放权，之后随着绝对减排量的增加和排放权的减少，免费发放的排放权将逐年减少。到2030、2050年，免费发放的排放权占比将分别降至30%和25%，其余排放权将通过拍卖发放。2012-2050年，美国政府计划将拍卖所得的50-60%用于补贴因能源价格上涨而受到损失的消费者，其余用于补贴水泥、钢铁等企业和支持清洁能源技术开发等方面(U.S. Congress,2009)。