清洁发展机制在实际运行中表现出一些局限性。一些分散型小规模的减排项目具有减排潜力大，且更有利于国家和地方可持续发展的特点，但这些潜在项目往往分布在发展中国家的相对落后区域或者是分布在最不发达国家。这些项目如果作为单个项目，不仅受限于方法学，还受限于较高的开发成本和交易费用。为此，从2005年12月联合国气候变化框架公约第11次会议暨京都议定书缔约方第1次会议开始，规划类清洁发展机制项目的国际规则开始酝酿，并于2007年7月缔约方第33次会议上颁布了规划类清洁发展机制的相关实施规则。

世界银行的碳基金体系中，2009年开始运行碳伙伴基金（CPF）专门用来支持规划类活动，并侧重支持那些尚没有享受到情境发展机制益处的地域，尤其支持能效以及城市碳金融规划活动。截至2013年10月23日,全球在联合国清洁发展机制执行理事会（EB）注册的PCDM项目共224个。其中2009年2个，2010年3个，2011年11个，2012年195个，013年13个，中国共注册了40个。其中中国最近的是2013年1月25日注册成功的“河北省动物粪便管理系统温室气体减排规划方案”该项目得到了世界银行碳伙伴基金的支持。