生物质发电是利用秸秆等生物质所具有的生物质能进行的发电，是可再生能源发电的一种，也是处理农林废弃物的有效途径。然而，在国家支持生物质发电产业发展的背景下，一些生物质发电企业的赢利水平却不甚理想，主要原因是生物质发电行业技术水平参差不齐，管理水平有高有低，各地项目资源量和供应模式情况差异很大，因此赢利水平差别较大。

秸秆等燃料资源收集难成为首要因素，国家推广的秸秆还田和秸秆气化等其他秸秆利用方式可能造成地方政府对秸秆利用政策无法保持持续，同生物质发电竞争燃料资源，加剧了秸秆收集难的问题。秸秆收集困难主要受制于运输和人力成本，秸秆体积大、质量轻，运输车辆超高超宽普遍存在，常被交警处罚，如果运输半径超过50公里，运输成本就会太高。另外，秸秆经纪人的数量还很少，如果农民雇工收秸秆，销售秸秆的收入远不抵人力成本，还不如一烧了之。

由于生物质电厂由省级主管部门审批，各地生物质电厂在短期内一哄而上，在区域燃料资源一定的情况下，企业布点增多，造成原料资源的恶性竞争，原料价格不断攀升。相对于同等规模火力发电，生物质发电投资成本要高出一倍以上，而且人力等运营维护成本也高于火力发电。在燃料价格、维保成本等综合费用持续上涨的情况下，0.75元/千瓦时的上网电价显得过低，使得生物质发电企业挣扎在盈亏平衡线上。对于一些附带供热的生物质电厂，供热收入提升了电厂的盈利水平，较之那些将售电做为唯一收入的电厂，其盈利能力相对要改善许多。

特别的，生物质发电行业中的垃圾发电是唯一拥有成熟商业模式的行业，由于拥有包括垃圾处理费、上网电价收入和碳减排收入三部分稳定的收入来源，因此其盈利能力要好于其他类型的生物质发电企业，也成为了行业内的投资热点。

基于资产的角度，目前垃圾焚烧发电市场的商业模式可以分为“轻资产”和“重资产”两种模式。“轻资产”模式以EPC、设计、咨询、运营等不参与投资的环境服务为主；“重资产”则更多地以投资带动其业绩增长，典型地商业模式有BOT/TOT、BOO、BT、收购兼并等。

自1988年我国第一座垃圾焚烧发电厂投产以来，经过不断的摸索，在经历了政府直接投资、政府特许大型国有企业经营和政府特许经营权市场招标三种商业模式阶段之后，垃圾焚烧发电最终形成了以政府特许经营权市场化招标-建设-运营-转让(BOT)为主流的商业模式，目前我国已投产的和在建的垃圾发电厂大部分都是这种模式。

垃圾发电项目具有前期投资大、运营成本相对较低的特点，采用BOT模式，政府可以用将来按政策征收的垃圾处理补贴费来发挥现实的环境效益，变以前的一次集中支付为分期支付，可以进一步减轻财政压力，有效地加快基础设施建设步伐，满足社会对公共工程和基础设施的需求。BOT模式可以从国际、国内乃至民间多渠道融资，对于国内民间资本和国外投资者，BOT模式可以在越来越激烈的市场竞争中提供一个长期的、具有稳定可靠投资回报的投资方式。